Вообще такого не должно быть, т.е. нажатие на снятие/постановку в охрану сигнализация понимает как переход из одного режима работы в другой, а работа замков это только один из тех подрежимов, которые меняются при переключении режима охраны. Самый главный и видимый показатель - это работа светодиодного индикатора сигнализации, в охране он мигает. Также, убедитесь, что авто действительно при повторном нажатии кнопки только дверьми управляет, т.е. попробуйте дверь открыть - если сирена сработает, то значит все же сигнализация в охране стояла и все верно работает. В противном случае нужно к установщикам обращаться и проверять проблему на месте.