Такое не должно происходить в принципе, если за открывание багажника отвечает сигнализация. Можете попробовать заново прописать брелок в память сигнализации несколько раз, чтобы удалились из память ранее сохраненные брелки.
Такие проблемы необходимо с установщиками на месте решать, дистанционно сложно ответить.