Проблема может быть из-за подключенного датчика температуры к кнопке капота, когда сигнализация его опрашивает может и происходит ложное срабатывание, здесь можно попробовать на датчик капота протянуть от блока отдельный провод не используя штатную проводку или же проверить работу запуска по температуре. А если у Вас еще и температура на брелок не выводится, то возможно сам датчик температуры неисправен.
Что касается багажника, то при его открытии с брелка сигнализации отключается концевик багажника и датчик удара, поэтому по этим зонам срабатывания быть не должно.