При подключении сигнализации установщик должен запрограммировать работу автозапуска. После этой процедуры от пользователя уже не требуется каких-либо манипуляций с программированием.
Если у Вас авто с МКПП, то для реализации автозапуска необходимо предварительно выполнить процедуру "программной нейтрали", иначе система не даст запустить двигатель. В инструкции по эксплуатации этот момент прописан, стр.41:
https://avtogsm.ru/article/SK-5_manual-user.pdf