Да, при таком подключении оповещение об отключении питания будет приходить только после разряда батареи устройства бесперебойного питания.
Подключение бесперебойного блока питания вместо резервного аккумулятора не имеет особого смысла, так как он будет использоваться как аккумуляторная батарея, сама сигнализация уже имеет в себе схему подзарядки резервного аккумулятора который стоит дешевле чем бесперебойный источник питания.
По возможности организовать оповещения об отключении питания при использовании блока бесперебойного питания вместо сетевого адаптера, нужно проконсультироваться непосредственно в службе технической поддержке фирмы производителя сигнализации:
http://microline.ru/sections/Support/