Вам необходимо заново оба брелка прописать в память сигнализации, как это указано в инструкции, стр.19:
http://www.tomahawk.ru/images/stories/Catalogs/Tomahawk/Instruction/Tomahawk_TW-9020.pdf
Далее, необходимо будет снять сигнализацию с брелка с режима охраны. Также, вероятно Ваша система находится в режиме Anti-Hijack, информация по этому режиму есть в инструкции, стр.14