Причина как правило в неверном выборе источника или не проведенном программировании контроля запуска двигателя, чаще всего это бывает, если изначально контроль проверялся на программных настройках АКПП, а только после подключения установщик произвел выбор в настройках под ручную коробку. Вы можете получить информацию по выбору корректного подключения непосредственно в поддержке Vigilant:
http://www.rg-avto.ru/tech_support/question/