Отличия есть, например, Starline B94 Dialog позволяет подключить GSM модуль и управлять полноценно сигнализацией с телефона. Также, поддержка машин по CAN разная, так как модель авто не указали, можете самостоятельно проверить есть ли Ваш авто в списке Пандора и есть ли поддержка режима Слейв по CAN:
http://alarmtrade.ru/prog/Pandora_LX3297_Statusy_Komandy_150128.pdf
И СтарЛайн:
http://can.starline.ru/