Это может быть на некоторых авто именно после автозапуска в режиме Слейв, а именно происходит из-за того, что в момент автозапуска блок обхода отключает иммобилайзер, но после окончания автозапуска он переходит обратно в режим блокировки, а когда Вы с меткой подходите к машине, то происходит уже не снятие системы с охраны, а только отпирание дверей, блокировка штатного иммо не снимается, поэтому система выдает предупреждение. Такое на некоторых корейских авто встречали.
Еще вариант в неправильном подключении сигнализации, но это остается проверить только на месте установщикам. Мы бы Вам еще посоветовали продублировать проблему в тех. поддержку СтарЛайн:
http://www.ultrastar.ru/4375