Если оба брелка не реагируют, то скорее всего проблема в антенном модуле сигнализации, Вы можете для начала попробовать в брелках батареи поменять, а также перепрограммировать их в память сигнализации, стр.54 инструкции:
http://www.mega-f.ru/common/img/uploaded/SK-logicar_USER.pdf